fst::M2MFstAligner Member List

This is the complete list of members for fst::M2MFstAligner, including all inherited members.

_compute_penalties(LogArc::Label label, int lhs, int rhs, bool lhsE, bool rhsE)	fst::M2MFstAligner
_conditional_max(bool x_given_y)	fst::M2MFstAligner
alignment_model	fst::M2MFstAligner
entry2alignfst(vector< string > seq1, vector< string > seq2)	fst::M2MFstAligner
entry2alignfstnoinit(vector< string > seq1, vector< string > seq2, int nbest, string lattice="")	fst::M2MFstAligner
eps	fst::M2MFstAligner
expectation()	fst::M2MFstAligner
fsas	fst::M2MFstAligner
isyms	fst::M2MFstAligner
M2MFstAligner()	fst::M2MFstAligner
M2MFstAligner(bool seq1_del, bool seq2_del, unsigned int seq1_max, unsigned int seq2_max, string seq1_sep, string seq2_sep, string s1s2_sep, string eps, string _skip, bool _penalize, bool penalize_em, bool restrict)	fst::M2MFstAligner
M2MFstAligner(string model_file, bool penalize, bool penalize_em, bool restrict)	fst::M2MFstAligner
maximization(bool lastiter)	fst::M2MFstAligner
penalize	fst::M2MFstAligner
penalize_em	fst::M2MFstAligner
penalties	fst::M2MFstAligner
prev_alignment_model	fst::M2MFstAligner
prevTotal	fst::M2MFstAligner
restrict	fst::M2MFstAligner
s1s2_sep	fst::M2MFstAligner
seq1_del	fst::M2MFstAligner
seq1_max	fst::M2MFstAligner
seq1_sep	fst::M2MFstAligner
seq2_del	fst::M2MFstAligner
seq2_max	fst::M2MFstAligner
seq2_sep	fst::M2MFstAligner
Sequences2FST(VectorFst< LogArc > *fst, vector< string > *seq1, vector< string > *seq2)	fst::M2MFstAligner
Sequences2FSTNoInit(VectorFst< LogArc > *fst, vector< string > *seq1, vector< string > *seq2)	fst::M2MFstAligner
skip	fst::M2MFstAligner
skipSeqs	fst::M2MFstAligner
total	fst::M2MFstAligner
write_model(string model_name)	fst::M2MFstAligner